随着生物发酵领域市场规划的不断扩大，微生物发酵产品的市场潜力也被不断开发，传统的发酵方法和规划现已远远满足不了消费需求。针对现在制药机械自动化、生物发酵罐、一体化的趋势和安全、卫生的标准，
常见的生物发酵罐分为固体发酵罐和液体发酵罐。发酵罐依据容积和用途不同，分为种子罐(菌种发酵罐)和发酵罐。发酵罐依据需氧类型的不同又分为通风式发酵罐和厌氧发酵罐。
生物发酵罐的罐体尺度从50L-5000L全系列，并可依据用户需求规划制造。
通风发酵的拌和设备包括电动机、传动设备、拌和轴、轴密封设备和拌和桨。机械拌和的意图是迅速涣散气泡和混合参加物料。一个拌和桨要一起达到这两个意图，有时是矛盾的。例如，达到混合功用需求大直径的拌和器和采用低转速工作，而提高涣散气泡作用则需求多叶片、小直径和大的转速。电动机输入功率决定于拌和桨方法和其他发酵罐部件。发酵罐内常装置4块挡板以增加混合、传热和传质功率。挡板之宽度为发酵罐直径的10%～12%，挡板越宽则混合作用越好。在好气深层发酵罐中，来自无菌空气体系的压缩空气经过空气散布器射入发酵罐内，散布器有单孔管式和多孔管式。装置方法各异，一般装置在下面一档拌和器的下方，但都要注意避免气孔被发酵液中的菌体或固体颗粒堵塞。有的空气散布器带有放水结构，使放罐后没有发酵液残留在管子里。通气速度以满意微生物发酵的需求为准，在使溶氧在临界氧深度之上。它决定于体系的规划和操作。空气流速的上限速度是空气能有效地被拌和桨涣散，这和拌和桨方法和转速有关。
微生物在繁衍和耗氧发酵过程中都需要氧气，通常以空气作为氧源。空气中含有林林总总的微生物，这些微生物跟着空气进入培养液，在适宜的条件下，它们会许多繁衍，耗费许多的营养物质，以及发生各种代谢产品，搅扰乃至损坏预订发酵的正常进行，使发酵产品的效价降低，产值下降，乃至造成发酵*失败等严重事故。因此，空气的除菌就成为耗氧发酵工程上的一个重要环节。除菌的方法许多，如过滤除菌、热灭菌、静电除菌，辐射灭菌等，但各种方法的除菌作用、设备条件、经济条件各不相同。所需的除菌程度根据发酵工艺要求而定，既要到达除菌作用，又要尽量简化除菌流程，以削减设备投资和正常运转的动力耗费。
过滤除菌是目前发酵工业中经济实用的空气除菌方法，它是选用定时灭菌的介质来阻截流过的空气所含的微生物，而取得无菌空气，常用的过滤介质有棉花、活性炭或玻璃纤维、有机合成纤维、有机和无机烧结材料等等。由于被过滤的气溶胶中微生物的粒子很小，一般只有0.5~2μm，而过滤介质的材料一般孔径都大于微粒直径的几倍到几十倍，因此，过滤机理比较复杂。一起，由于空气在紧缩过程中带入的油雾和水蒸汽冷凝的水雾影响，使过滤的要素改变更多。当过滤介质孔隙小于或被过滤的微粒直径时，一般称为肯定过滤。跟着工业的开展，过滤介质逐步由天然材料棉花过滤到玻璃纤维、细玻璃纤维和其他浇结材料的过滤介质及微孔超滤膜的肯定过滤。目前，在许多发酵工厂运用膜原料进行空气除菌，取得了较好的效果。
